Beilstein 使用培训（一）　        ----化学合成反应的检索                   CrossFire Commander 7.0 使用界面 CrossFire Structure Editor 功能键的介绍 原子或官能团通式的缩写 使用CrossFire自带的模板画结构 定义反应物和产物 定义反应中心及手性翻转情况 结构大小及字体的调整 检索主页面 定义可能具有互变异构体的结构 定义两个取代基的杂环 定义两个取代基的杂环 定义环状和非环状结构 定义环状和非环状结构 定义环状和非环状结构 定义检索结构 定义检索结构 对反应检索结果进行限定 对反应检索结果进行限定 对反应检索结果进行限定 通过相关反应查找反应合适的条件 寻找相似结构的合成方法 寻找相似结构的合成方法示例 寻找相似结构的合成方法示例 通过相似结构的合成方法设计的路线 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 添加可相互转换的官能团示例 添加可相互转换的官能团示例 添加可相互转换的官能团设计合成路线 改变键的性质 添加可相互转换的官能团 添加可相互转换的官能团或改变键设计合成路线 查阅各核心结构的合成方法进行组装 使用Beilstein对复杂结构进行命名 使用Beilstein对复杂结构进行命名 如何将检索结果导出 Question  & Comments 限定检索结果的反应物为产物倒推合成路线 * Part III: 利用Beilstein 确定合成路线 * 首先检索文献有没有 相同分子的合成方法 有相同分子的合成 没有相同分子的合成 文献方法合理 文献方法不合理 （Cost, Scale up) 设计新的合成路线 寻找相似结构 的文献合成方法 查阅核心结构进行组装 添加可以相互转换的 官能团或改变键的性质 采用文献路线 反应检索的基本原则 * 设计合成路线（一） * 尽量注意分子具有类似性,这样将其反应条件应用   到我们所要合成的分子中将更可靠.  变换官能团的取代位置，扩展检索范围 非反应的基团相同位置设为Free site 将分子中无关重要的非反应中心为部位变为Free site 设计合成路线（一） * 点击反应物,追溯文献合成路线 设计合成路线（一） * 设计合成路线（一） * 设计合成路线（二） * 文献中找不到类似结构的合成方法； 相关类似物的合成方法很少，找不到较为合适路线 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线（二） * 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线（二） * 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线（二） * 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线（二） * 设计合成路线（二） * 设计合成路线（二） * 设计合成路线（二） * 设计合成路线（二） * 设计合成路线（三） * Part IV: 其他功能介绍 * 将Chemdraw不带缩写的结构复制到CrossFire 检索主页面，点击Autonom键 * * 药明康德新药开发有限公司 药明康德版权所有 * Part I: 基本检索方法介绍 * 打开Beilstein页面后选择数据库 选择数据库 * * 选择化学结构的绘图工具 选择绘图工具 使用较为方面，　一般是默认设置 * 编辑状态 选择结构或基团 橡皮 旋转 放大 缩小 画线 Clossfire 点击后进入检索页面 * 原子的定义 * 官能团的定义 * 最后的字母改为Ｈ,代表该结构和氢都可以。以下几个也是常用的：Ａ：任意原子；　Ｑ：除C,H的原子　Ｍ：金属原子　Ｘ：卤素原子AH, QH, MH, XH则代表这类分子或氢原子 * 选择设定任意取代 取消任意取代 选择多个原子定义任意取代基 * 各种键的定义 * 单键，快捷方式 s + 回车 双键，快捷方式 o + 回车 三键，快捷方式 t + 回车 任意键，快捷方式 a + 回车 单或双键，快捷方式 i + 回车 双或单键，快捷方式 d + 回车 标示手性中心的实线，快捷方式 u + 回车 标示手性中心的虚线，快捷方式 w + 回车 手性中心的不，明，快捷方式 e + 回车 双键立体结构，快捷方式 b + 回车 各种键的定义和快捷方式详解 * 快捷方式打开后某类模板后则成默认方式，要打开其他模板从File工具栏打开 内存结构模板 * 使用CrossFire自带的模板介绍 氨基酸 芳环 原子链 环烷 杂环 天然产物 原子族 卟啉 其他 甾体 糖-线状 糖-环状 多萜 天然产物 核糖核酸 * 结构定义状态 画线将反应物和产物的共同原子连起 * 在定义状态下，单击反应连线的一端，跳出如右对话框，可设定反应中心(反应中心or非反应中心)及手性翻转情况（构象翻转or保持） * * 从ChemDraw中复制化学结构 使用方法： 从ChemDraw中复制结构后，在检索主页面使用Ctrl+v 或右键单击后左键点Paste。  Note：1.  此法进入编辑器后无效；但可以在主页面复制后再进入编辑器          2.  结构中不能含有ChemDraw自带的模板，不能有任何缩写（无法识别）。 * 检索主页面定义检索属性－检索单一结构可用 杂原子任意取代 原子任意取代 作为结构检索 作为反应物检索 作为产物检索 * * 选择检索反应，点击Start Search后开始检索 * Part II: 检索技巧介绍 * 通过产物的结构对反应进行限定 结构与官能团分开画，并且都free site可以表示官能团的任意位置取代 代表分子结构中含有吡啶环及硝基，自然就包含了邻、对、间位的硝基吡啶。但有时范围可能过大，包含许多非期望的结构信息，可以通过其他方法加以限定 * 通过产物的结构对反应进行限定 在产物中带有敏感官能团的情况下选择性的反应检索示例 * 定义可能具有互变异构体的结构 * * 改变键的性质，选择或点击相应的键修改 包含所有的芳环结构，再文字定义 包含所有的芳环结构，再文字定义 * * * 药明康德新药开发有限公司您在中国医药领域的职业归宿 药明康德版权所有 公司概述 国内首家以组合化学技术和现代药物化学为核心，致力于为国内外制药及生化企业提供药物及化学研发服务的企业。  目前，公司已与美国、欧洲和日本等发达国家的60多家国际一流的制药巨头和著名的生物技术公司建立了长期稳定的业务关系，其中包括19家全球排名前20位的制药公司，8家前10位的生化制药公司。   2003年，荣获“高新技术企业” 称号。 公司概述 公司概述 2004年度德勤亚太地区高科技高成长500强的评选活动中， 药明康德晋身亚太地区高科技高成长500强，名列第九名。  2005年9月，药明康德荣获“Red Herring亚洲100强企业” 的称号；2005年8月1日，药明康德被选为Red Herring的封 面介绍，李总成为封面人物。    公司的重要客户    2003年，全球在新药研发上投入最大的十大制药公司,有八家均为我公司的重要客户。  世界重量级的专家顾问团  Dr.John J. Baldwin：美国著名药物化学家，享有“药典”美誉，现任药明康德公司首席顾问。曾任美国默克公司的高级技术主管，并获得“最杰出科学家”终身奖，拥有160多项专利和3个上市新药的发明权。  Dr. Clark Still：美国哥伦比亚大学的化学教授，
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