为什么要提高空间群的对称性?有时候在对称性较高的空间群内不容易解得初结构,在这种情况下可以降低对称性来解,但是解完以后还要把空间群转换回去。安装Platon从其主页上下载http://max.book118.com.ac.uk/~louis/software/platon/http://max.book118.com.ac.uk/~louis/software/platon/pwt_setup.ziphttp://max.book118.com.ac.uk/~louis/software/platon/platon.zipDownload the PLATON for Windows Taskbar 和Download the PLATON executable.然后解压安装,首先安装pwt,安装时需设定系统环境变量,安装后再将platon解压后复制到pwt的安装目录内即可。运行pwt.exe点击File--Select Data File,选择要升高对称性的结构文件*.res或者*.ins。再点击Publish-addsym 系统显示检查画面,如提示有更高对称性的空间群,则原先空间群有误,需要进行转化。再点击Publish-addsym shelx,可以生成一个新的同名*.res文件,此res文件会将原先的res文件覆盖,在此文件的基础上继续精修即可。应该没有任何问题,已经试过很多次了!最好用xp打开此res文件,然后再file一次,再作经修xp中, 用mpln定义平面,仔细看那个方程(大家用xp操作时不要太快,因为那个方程第一个出来,一块就找不到了),方程的等号右边有一个常数,你算第一个平面时将它记下,不过最好将望着的方程记下,然后再算第二个平面,又有一个方程,记下常数项,然后二者一减就是二者的距离,不过平面越是完全平行这个值越接近他俩的真实距离,平行与否可以看大家都能看到的那个夹角,另外也可以看刚才的方程的系数,系数相同或者成线形比例,就平行.我的CIF文件里的对称代码 2_556 1_545 请问这些对称代码是如何算出来的?? 在考虑对称单元的时候,在ShelxTl里面考虑x,y,z均为9个单胞的范围,并且把N_555规定为最初的单胞,即此单胞内的原子坐标均小于1,如果一个对称单元出现的下(x+1,y,z)的那个那个单胞内,则相应的堆成码就变成了N_655,其他的如此类推,比如在(x-2,y+1,z+2)的单胞内,对称码就为N_367,总之都是以N_555为最中心做相应的加减,这应该比较好理解。在那么大的范围内,我们希望长出来的对称单元应该都可以长出来了。我们常见的对称码都在N_555附近,很少有大于N_777的和小于N_333的。 下面再来说前面的N_555中的“N”的含义,它表示对称操作(symmetry operators)的类型,它可以在XP界面下由SYMM命令得到,第几个对称操作,N就相应是几了。N在不同空间群内代表的对称操作是不一样的。 欢迎大家继续讨论。(1)画堆积图是是按什么原则的? (2)在堆积图中我找到两个分子有堆积作用,但是我如何知道这两个分子是按什么对称代码得到的。也就是说我要得到这样的两个分子,采用什么代码画出来?在xp 中用envi ##找出与第一个分子有作用的原子sgen/mgen##生长我看见一些高手在解晶体时,时不时地查一下国际表。我是个新手,请问哪位高人告诉我国际表究竟能给出啥信息?对解晶体到底有什么帮助?严格意义上,解晶体要知道等效位置的分布情况。高手会手工导出,但推导很费时,所以才有捷径--查表。常用的目的有三:一是等效位置点,对一个晶体,不对称单元的原子一般要位于晶胞内靠近原点的等效点上,这是经常查表的理由之一。不过,现在这一工作可在解完后交由PLATON协助处理,但高手是在解的过程中就将这一问题解决了。二是空间群的合理性,这要结合LST得知的衍射反常点情况进行判断。这点程序XPREP尽管有提供,但程序常常不尽合理,它只取前N个数据点处理。不过,由消光规律得出可能的空间群所需的知识很少。大家应该掌握!三是空间群的提高和降低问题,就是子群、同构群和母群问题。这点即便是非常的高手也是要经常查表的原因。另外,从子群、同构群和母群的关系也可以解释U因子为什么在某方向大、在某方向小,同时也可预期晶体可能具有的功能性。建议在你开始时,补充一下这方面的知识。这是解结构应该要尽可能具备的技能。C1 1 0.121652 0.246027 0.442076 21.000000 0.069420C2 1 0.060125 0.250156 0.502590 21.000000 0.089850O1 4 0.741193 0.420737 0.921086 11.000000 0.097190 0.042270 = 0.043310 0.034400 0.003990 0.026710O2 4 0.568563 0.291549 0.810126 11.000000 0.061080 0.056650 = 0.044460 0.023300 -0.000630 0.023610如上是INS文件中的数据,请问第六列的21.000000何解, 多谢通常21与-21成对出现,这表示一个原子统计在两个位置上,期占有率之和为1。比如FVAR 0.16832 0.7534PART 1C2A 1 0.255905 0.173582 -0.001344 21.00000 0.04351PART 2C2B 1 0.299373 0.178166 -0.015708 -21.00000 0.03516PART 0这表示C2占据A和B两个位置,PART 1的部分一般为21,PART 2的部分为-21,FVAR变量的第二个数字(0.7534)表示A位置(21)的实际占有率,而(1-0.7534)则表示B位置(-21)的实际占有率。哦,看来是我是用Xshell时产生的可不可以设置让一个PART的占有率自动精修,怎样实现,谢谢如果想对某个原子的占有率进行精修,可以把它的占有率改为1.000,然后精修,Xl以后会发现1.000有所改变我是这样做的,可是发现本应该占位几率一样的一组原子被精修的占位不一样了,虽然相差不是很大,但R值下不去,所以我想可能就是因为这个不一样所导致的。不知道是不是有让这一组原子在占位大小一样的情况下精修占位度。可能说不不太明白,是这样:As1 As2 As3 As4As5 As6 As7 As8这是赤道皇冠形宠状多酸球里的二组As占位序列,每组里的As占位应该是一样的,但不确定各组占位是多少,最理想当然是各组0.50000,但是好象不是这样的你也可以把精修后的占有率固定,比较接近的占有率固定成一样的,但是要保证2个原子的占有率之和要等于1,试试看,统计和无序是最难精修的,可以参见如下网页:http://shelx.uni-max.book118.com/~peterm/tutorial/do-intro.htm如何根据对称代码来画图??我画了C-H...O氢键图,可编辑说我图画的不对!,提了如下意见:The first probl
单晶结构解析常见问题问答.doc
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