英文医学数据库检索（上）中南大学刘雁书liuyanshu@sina.com  教学内容一、重要外文检索系统及其获取 二、Pubmed 文献检索系统 三、EMBase 四、Scifinder Scholar 五、Biosis Previews 六、中南大学馆订电子期刊导航七、如何查到满意文献 一、重要外文数据库及获取途径重要外文数据库外文文摘数据库检索(P.84) Medline 与Pubmed, EMBASE, SciFinder Scholar, BioSIS Previews, Engineering Village, Dialog  外文全文数据库检索(P.113) OVID Full Text, EBSCOhost, Elsevier SDOS, SpringLink, ProQuest Medical Library, Kluwer Online Journals OCLC FirstSearch 馆藏电子刊导航公共网可获取外文文献数据库Pubmed 文献检索系统www.book118.com ( 文摘，部分全文）2. Google 学术论文检索：schwww.book118.com( 文摘，中外文，部分全文）3. Scirus 科学搜索引擎www.book118.com ( 文摘）中南大学医学图书馆外文数据库资源校园网可获取外文文献资源中南大学医学图书馆：www.book118.com 可获取重要外文数据库：SciFinder (CA) Web of Knowledge (SCI) EMbase Biosis Preview EI 工程索引ISTP 科学技术会议录索引博硕士论文文摘数据库PQDD Micromedia 临床及循证医药学数据库医学图书馆可获取外文全文数据库Elsevier 全文数据库OVID 全文数据库Proquest 全文数据库Springer 全文数据库PHMC 全文数据库NSTL 引进的全文期刊EBscohost 全文数据库WorldScinet 全文数据库American Chemical Society(ACS) Royal Society of Chemistry(RSC) 中南大学校本部图书馆外文数据库（部分） 二、Pubmed 文献检索系统二、Pubmed 文献检索系统（一）沿革（二）可获取资源（三）基本检索功能（四）检索结果获取及相关功能（五）高级检索方式（六）个性化检索工具（七）Mesh Database  （一）、P ubmed 沿革1、Index Medicus,IM 美国国立医学图书馆（NLM）编辑出版创刊时间：1879年收录期刊：4900+ 多种范围：全世界，生物医学2 MEDLINE 数据库包括三本印刷本的内容：Index Medicus，IM 美国医学索引Index to Dental Literation 牙科文献索引International Nursing Index 国际护理索引2. Medline 数据库出版单位：美国国立医学图书馆（NLM）学科：生物医学文献类型：4 900 多种期刊论文线索（题录+ 文摘）年限：1966 - 范围：全世界，英文文献为主（70%）Medline 数据库检索方式光盘：Medline on CD-ROM 互联网：1997: Pubmed 2000: NLM Gateway ( gatwww.book118.com.gov ) 其他：Medscape NLM Gateway 检索系统Medscape 检索系统校园网Medline 访问方式访问网址:www.book118.com 访问路径: 1. Pubmed/Medline ：检索方式与公共网检索Pubmed 相同，校园网上访问可以直接获取我校已订购的论文全文2. Embase ：可以一次性检索Medline 及Embase 数据库，并自动去重3. SciFinder Scholar ：可以一次性检索Chemical Abstract 和Medline 数据库，并去重校园网访问Pubmed 检索结果界面3 Pubmed 文献检索软件NLM 下属的美国国家生物技术信息中心推出的基于WWW 的文献检索软件.可检索资源包括许多期刊出版商参与共建的Medline 数据库扩充版。网址：www.book118.com  （二）可获取资源自身资源Medline OldMedline PreMedline Publisher-supplied Citations 相关资源链接Related articles 生物信息学资源（P238 ）Linkout 免费期刊全文（PMC ）等资源Pubmed 记录来源Pubmed 主页（三）Pubmed 基本检索功能(P86) 逻辑组配检索字段检索（P85 ）自动词语匹配功能精确短语匹配功能截词检索作者检索作者检索Medline 原来对作者姓名处理是采用姓在前，用全称，名置后用缩写的方式2002 年起，Medline 在同时采用结合缩写与全称两种方式来处理作者姓名，作者姓名缩写放入[AU] 字段，全称放入[FAU] 字段西文检索工具对中国人名的处理较混乱。如Xia Jia-hui 文献可能被分散在“Xia JH”及“Xia J”下面，检索时需综合考虑，尽可能查全。作者检索示意Queries Results xia j 894 Xia j[au] 891 Xia jh 118 Xia jh[au] 118 Xia,jiahui 23 Xia,jiahui[fau] 23 （四）检索结果获取及相关功能检索结果获取、显示、排序及输出全文获取不必要的心血管支架手术？Q ：如何查找“不必要的心血管支架手术”英文原文出处？1. 输入提问式, 点击”Search”2. 获取检索结果3. 获取英文原文出处记录转换显示格式及输出Related Articles ：自动获取相关记录全文获取公共网获取方式：免费：Pubmed Central 或期刊网站收费：登录期刊网站图书馆：限于国外校园网获取方式在Pubmed 检索结果界面会自动显示我校订购的全文数据库中可获取全文篇数，点击数据库超链可获取全文。Pubmed Central “不必要的心血管支架手术”英文全文（五）高级检索方式Pubmed2009 年新推出的检索方式，集成了以往Pubmed 的Limits 、History 、Preview/Index 、Details 、Clipboard 等多项辅助检索功能Pubmed 高级检索方式界面I 高级检索方式界面II ：指定字段并进行组配检索高级检索方式界面III ：限制条件进行检索高级检索方式界面III ：查看并利用数据库索引进行检索高级检索方式界面IV ：获取更多相关资源(六）个性化检索工具( P89) Single Citation Matcher ：查找某篇文献准确信息Batch Citation Matcher ：批量核对文献信息Clinical Queries ：专供查找临床信息Topic-Specific Queries ：供查找专题文献信息Journal Database: 查找期刊信息及论文Single Citation Matcher 检索服务Batch Citation Matcher 检索服务Clinical Queries 检索服务Topic-Specific Queries 检索服务Journal Databases 检索服务( 七）利用主题词检索Pubmed Mesh Database 检索功能主题词：词汇类型（P30 ）主题词( Mesh Heading)，又称叙词Descriptor, 从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语款目词，又称入口词，entry word, 主题词的同义词或近义词副主题词（Subheading）, 又称为限定词（Qualifiers）, 对主题词进一步限定的规范化用词主题词：形式选词范围：包括生物医学文献中能表达与医学或生命科学有关的概念，并具有检索意义的常用词或词组单个词：liver, brain 词组：直接：lung abscess  倒装：genes, tumor suppressor 主题词特性：动态性动态性：词表每年修订如”Influenza A Virus, H1N1 Subtype”（流感病毒A 型，H1N1 亚型）是2006 年才正式作为主题词的，1978-2005 年间相关文献是放在“Influenza A Virus”（流感病毒A 型）主题词下的。医学词汇关系款目词与主题词用代参照，符号“see”、”x”主题词与主题词交叉关系：相关参照“see also”“genes, tumor suppressor”see also  “tumor suppressor proteins”包含关系：“Tree Structure”Tree Structure (P33) 主题词概念等级分类体系将所有主题词归为15大类，并逐级展开每一个主题词有一个Tree number genes, tumor suppressor  G14,330,415,400 医学主题词表印刷本：Medical Subject Headings, Mesh：检索者用Medical Subject Headings Annotated Alphabetic List, MeSHAAL : 专业人员用机读版MeSH Browser( 医学主题词浏览器)  ( www.book118.com.gov/mesh/mbrowser.html )  Pubmed Mesh Database 主题词检索优势1 1. 从主题词入手可以查全同一医学概念不同的术语表达, 提高查全率主题词检索优势2 2. 主题词可以组配副主题词，可以缩小检索范围，提高命中文献的相关度举例：茶碱治疗哮喘哮喘asthma[mesh] 61987 哮喘的药物治疗asthma/drug therapy 19695 茶碱（theophylline) 治疗哮喘2352 主题词检索优势3 3. 可以利用树状结构表进行扩展检索，查全某一主题文献举例Genes, tumor suppressor[Mesh,NoExp]  11737 Genes, tumor suppressor[Mesh]  32463 主题词检索优势4 4. 可以利用主题词的树状结构，灵活扩大或缩小检索范围17202 17134  1786 Mesh Database 检索举例课题举例：疯牛病的流行病学研究学生初拟检索策略mad cow diseases epidemic study 84 更好的检索方式：Mesh Database---- "Encephalopathy, Bovine Spongiform/epidemiology"[Mesh] 661 1.  查找mad cow disease 对应主题词（I ）1. 查找mad cow disease 对应主题词（II ）2. 选择主题词、副主题词送入检索框3. 点击”Search PubMed”进行检索4. 获取检索结果转换“MEDLINE”格式转换“MEDLINE”格式，获取主题词作业实习三MEDLINE 数据库检索Genes, Tumor Suppressor 树状结构表树状结构检出文献量该主题词引入年代组配副主题词款目词上位词I. 主题词前打勾II. 选择副主题词III. 选择”send to search box with AND”检索结果中综述篇数自动获取相关记录在NCBI 其它数据库中查找关联数据系统转换后的检索策略转换记录显示格式选择记录输出方式查看并利用已有的检索策略进行检索获取检索结果提供全文篇数获取检索结果提供文摘篇数主题词特性：单一性例如：肿瘤抑制基因tumor suppressor genes Tumor suppressor genes genes, tumor suppressor antioncogenes cancer suppressor genes growth suppressor genes Genes, tumor suppressor Entry term Mesh Heading “Genes, Tumor Suppressor”树状结构表副主题词进一步修饰、限定主题词的规范化用词。也是由主题词表规定的必须与主题词配套使用，单独使用没有意义其与其主题词组配范畴及使用规则都由词表严格规定动态的，现在共有副主题词83个（P36）副主题词也有树状结构Mesh Qualifier Data: therapy 10例AIDS 病人死亡因素分析1例艾滋病患者的诊断爱滋病患者常见之口腔表征治疗获得性免疫缺陷综合征病人的健康教育主题词：获得性免疫缺陷综合征*  * Medscape 可获取资源：Medscape ：医学新闻CME ：继续医学教育资源eMedicine ：在线医学专题文献数据库Drugs ：可获取20 多万种药物信息MEDLINE ：免费检索MEDLINE 可获取相应数据库中收录的全文基本检索方式高级检索方式查找思路：利用数据库：Pubmed 原文线索（检索途径）：作者：William Boden 来源期刊：新英格兰医学杂志(New Engl J Med) 英文原文出处：Boden WE, O’Rourke RA, Teo KK, etal. Optimal medical therapy with or without PCI for stable coronary disease. New Engl J Med, 2007, 356(15):1503-16