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免疫学检测中的曲线拟合.ppt
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
医学语言:简体中文
医学类型:国产软件 - 医药 - 医学ppt
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更新时间:2019-12-27 21:09:28
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免疫学检测中的曲线拟合.ppt介绍

免疫测定中的数据处理与曲线拟合免疫测定中的数据处理数据处理与科学作图免疫测定的数据处理及结果报告临床免疫检测技术:RIA 和EIA 等;数据处理的意义和目标:只有在测定结果以一种有意义的方式报告时,测定结果才有用;免疫测定结果的客观评价,对改善免疫测定的重复性以及免疫测定的标准化都有重要意义。数据处理报告的要求:通俗易懂;定性结果明确,定量范围明确;处理后得到的数据要具有可重复性;试验的评价不能建立在假定的正态分布上;结果具有用于进一步分析处理(如流行病学)的充分性。免疫测定以其测定结果的表达方式:定性,定量两类。定性测定--- “有”或“无”判定结果:阴性,阳性。判定依据:cut-off 值,S/N or P/N 比值。判断依据确立原则:尽可能避免假阳性和假阴性结果的出现。应用:传染性病原体的血清标志物检测。定性测定数据处理--cut-off 值的确定定性测定数据处理--cut-off 值的确定使用ROC 曲线设定cut-off 值:ROC 曲线:横坐标为假阳性率FPR=[ 假阳性数/ (假阳性+ 真阴性)] 		 纵坐标为真阳性率TPR=[ 真阳性数/ (真阳性+ 假阴性)] ROC 曲线的含义:定量测定--- 测定待测物的含量判定结果:浓度(U/L ,μg/L )。判断依据:测定未知标本的同时,以系列浓度标准品测得的剂量反应曲线(即标准曲线)以此推算未知标本的浓度。剂量反应曲线:一般均为非线性的,不同的数学模式可以用来改善上述剂量反应曲线绘制的精密度,从而以较少的数据和计算获得较为准确的结果。应用:非传染性血清学指标。免疫测定中的剂量反应曲线(相对于定量生化):非线性→测定反应和待测物浓度之间的关系不一定是一条简单的直线;可能存在与系列标准品的测定数据拟合的多条曲线→可能因曲线的选择而造成偏差;具有相对大的且方差不齐的测定误差,且在标准曲线的不同位置、在不同批的测定之间这种误差亦不同。单纯线性回归往往不能反应真实情况数据处理与科学作图问题:给定一批离散的数据点,需确定满足特定要求的曲线或	 曲面, 从而获取整体的规律。目标:用一个解析函数描述一组(二维)数据( 通常是测量值) 。方法:插值法-- 数据假定是正确的,要求以某种方法描述数据点之		间所发生的情况;曲线拟合或回归-- 设法找出某条光滑曲线,使它最佳地拟合		数据,但不必要经过任何数据点。曲线及相应数学		公式表明数据对(如标准品浓度与测定信号)之间		的比例关系。插值法interpolative methods 假设:反应变量的已知绝对精密;曲线构建:以观察到的数据构建曲线;方法:点对点(线性插值)样条插值spline function 点对点(线性插值)假设:中间值落在数据点之间的直线上;当数据点个数增加和它们之间距离减小时,线性插值就更精确;适用范围:线性范围大或数据点多且相互紧密相连;处理:为使数据更具有线性关系,可对数据进行某些方式的转换(如对数转换),然后在转换数据上进行线性插值。采用某些更光滑的曲线来拟合数据点;最常用的方法是3 阶多项式,对相继数据点之间的各段建模,这种类型的插值被称为3 次样条或简称为样条;处理:为将每一个短曲线相互之间平滑地连起来,需对其进行修饰(smoothing ),这需要反复重新计算所有的曲线直至每一片段与其数据点的拟合间的连接可以接受。结点(knots ,校准物的浓度值)越多意味着数据处理工作量的增大;适用范围:当希望曲线密切遵循单个的校准物数据点时,或数据非常精密并有多个校准物时可选用,否则应避免使用;特点:完全拟合试验数据;	 每一片段基本上与其他部分无关;问题:对数据点的精密度和准确性依赖大;	 每一个片段都应有一个质控样本,而这往往是做不到的;	 无法完全解决hooks 出现引起的不准确;	 有时较其他“复杂”模式更费时。影响因素:确定某部分曲线的两个校准点的准确度和精密度。曲线拟合问题的提法:已知一组(二维)数据,即平面上n 个点(xi,yi) i=1,…n, 寻求一个函数(曲线)y=f(x), 使f(x) 在某种准则下与所有数据点最为接近,即曲线拟合得最好。曲线构建:以符合数据点规律的经验模式构建曲线;目标:反映对象整体的变化趋势;达到最佳拟合的方法——线性最小二乘准则;拟合模式:双曲线模式hyperbolic model 多项式模式polynomial model Log-Logit 转换Logistic 公式(两参数,四参数)2 阶曲线拟合与10 阶曲线拟合1 )将校准物浓度的倒数对测定反应作图或以B0/B 对校 准物浓度作图; 2 )最小平方线性回归。1 )将测定反应对校准物浓度作图; 2 )对多项式进行最小平方回归。适用范围:一个三次多项式可被快速和成功地用于竞争免疫测定数据拟合;非竞争性免疫测定:有部分校准曲线为直线,可能拟合不好;x 的次方为非整数时能够再现校准曲线的实际线性部分,但在零浓度附近和高浓度时不准确,需要截尾。问题:一个给定反应值可能对应两个结果,因此需对校正曲线进行截尾。1 )将logit (B/B0 )对校准物浓度的对数作图;2 )对转换后的曲线进行最小平方回归可得到良好的直线。适用范围:竞争免疫测定数据拟合。问题:不能包含零校准物点;不能包含放免中的非特异结合数据。1 )将测定反应对校准物浓度的对数作图;2 )对转换后的曲线进行最小平方回归。优点:不会出现钩状(hooks );问题:与直线公式相比logistic 公式在代数学上是一个相当复杂的公式,因此要找出“最佳拟合”相对较难;参数:a ,b ,c ,d 四参数,或带入a&d 值,则为b ,c 两参数。例:在fPSA 免疫分析中,四参数logistic 拟合和四次多项式拟合最接近真实值。剂量反应曲线:通常为S 形或双曲线。目标:曲线线性化,获得数学模式。方法:转换一个或两个变量(对数或倒数);多项或其他方式的曲线线性回归或比例转换(logit) 。最低要求:应用时经济省时;一个反应变量只对应一个剂量结果(无hooks 出现)。质量作用定律模式和Scatchard 作图曲线构建:从化学原理(抗原抗体之间的反应符合质量作用定律)计算校准曲线。原理:Ag+Ab AbAg ,		 Ka= ,=Ka (n-[AbAg] )	 n 为反应孔中抗体的最大结合能力,以mol/g 抗体表示,Ka 是平衡常数。Scatchard plot 绘制方法:以[AbAg]/[Ag] 比值对[AbAg] 作图可得到一条直线;计算机软件作图。相关应用软件Thermo labsystems 酶标仪:可进行的曲线拟合类型包括LINEAR REGRESSION ,POINT TO POINT ,QUAD. POLYNOMIAL ,CUBIC POLYNOMIAL ,CUBIC SPLINE ,QUARTIC POLYNOMIAL ,4 PARAM. LOGISTIC ,从中选出最佳拟合(“best fit”)。Program :RIA AID, ELISA AID (Robert Maciel Associates, Inc. Arlington, MA) 通用的处理程序,可进行log-logit( 加权、非加权)、四参数logistic 拟合、多项式拟合、点对点拟合等,可用于RIA 和EIA 。CurveExpert 1.3 :linear regression models, nonlinear regression models, interpolation, or splines. Over 30 models 。有关概念准确度accuracy—实验测得的分析物浓度与其真值之间符合程度。标准差standard deviation, SD —一组数据的离散度。变异系数coefficient of variation, CV —标准差以其均数的百分比来表示。重复性reproducibility —通过重复测定的SD 或算术平均值的区间值来考察。测定下限detectability —超过零剂量精密度的最低抗原浓度。敏感性sensitivity —实验的测定反应对待侧物质浓度变化的改变,即dR/dC 。夹心ELISA 校准曲线优化:为得到更大的线性范围,可提高包被抗体和检测抗体的用量;标准曲线的不同位置精确度不同,这影响到标准曲线上数据点的疏密分布,并需要相应的质控品;不同批标准曲线之间亦有误差,因此每批实验都应重新坐标准确性。Referrence 李金明,临床酶免疫测定技术. 人民军医出版社,2005. James T. Wu, PhD. Quantitative immunoassay: a practical guide for assay establishment, troubleshooting, and clinical application. 数学建模与数学实验—拟合,海军航空工程学院青岛分院教程. 曲线拟合与插值. Stephen P. FitzGerald, etc. Development of a High-Throughput Automated Analyzer Using Biochip Array Technology. Clinical Chemistry 2005 ,51:7. + + + + + f=a1+a2x + + + + + f=a1+a2x+a3x2 + + + + + f=a1+a2x+a3x2 + + + + + f=a1+a2/x + + + + + f=aebx + + + + + f=ae-bx 1. 通过机理分析建立数学模型来确定f(x) ;2. 将数据(xi,yi) i=1, …n 作图,通过直观判断确定f(x) :拟合函数的选择:n=1 作为阶次,得到最简单的线性近似。通常称为线性回归;n=2 作为阶次,得到一个2 阶多项式;高阶多项式给出很差的数值特性,不应选择比所需的阶次高的多项式。拟合曲线的阶次:双曲线模式hyperbolic curve :曲线形状:双曲线;假定数据拟合下式:y=a+b(1/x) 或(1/y)=p+q(x) 。 多项式模式:曲线形状:抛物线;假定校准曲线拟合下述曲线形式;y=a+bx+cx2+dx3+……+pxn 。 Log-Logit 转换:曲线形状:具有单点屈曲的连续性S 形函数;	 假定校准曲线拟合下述曲线形式:	logit (y )=a+b*ln (x ),其中logit (z )=ln[z/ (1-z )] 。 Logistic 公式(两参数,四参数):曲线形状:具有单点屈曲的连续性S 形函数;假定校准曲线拟合下述曲线形式:	 logistic 公式:Y= +d	x 以对数表示时曲线呈线性。 	 1+ (X/C )b a-d 拟合模式:双曲线拟合hyperbolic curve :y=a+b(1/x) 或(1/y)=p+q(x) 问题:标准曲线的端值得不到好的拟合(特别是低浓度端);测定误差为倒数,与实际误差规律相反;不具有S 形,限制了应用。双曲线拟合模式:竞争性免疫测定数据(在限定范围内的值)能拟合很好的平滑曲线。双曲线模式hyperbolic curve 应用多项式拟合:多项式模式应用Log-Logit 转换曲线:logit (y )=a+b*ln (x )logit (y )=a+b*ln (x )Log-Logit 转换应用:Logistic 公式(两参数,四参数):Y= (a-d )/[1+ (X/C )b]+d 两参数:a=y0 ,d=yx y= (y0-yx )/[1+ (X/C )b]+yx Y=log(y0-y)/(y-yx)=logit(y), X=log(x), A=-b, B=-blog(c) Logit(y)=Alog(x)+B 四参数:不依赖于y0 和yx 的测定,更好地拟合原始数据。Logistic 公式(两参数,四参数)应用Figure 2 Effect of curve-fitting program applied on the degree (extent) of deviation of fPSA values from expected mean 

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